1998年，連穎科技成立，憑著對知識管理的敏銳眼光，著手投入專利分析技術領域以及全球各大專利資料庫的研究。 2000年七月，連穎科技的代表作Patent Guider在連穎科技優秀研發團隊的長期努力之下終於誕生，成為全球最具競爭力的專利檢索與分析軟體，連穎科技也成為台灣第一家以資訊技能整合智慧財產權專業的公司，Patent Guider於十一月上市之後在各界得到極佳的肯定，為企業增加專利檢索的便利性與節省企業成本，使企業在專利智權的應用上能夠取得先機，也奠定了日後連穎科技在專利檢索系統發展、專利資料庫建置、專利分析系統研究、智權管理系統開發……等的基礎。

2001年一月，連穎科技向美國專利暨商標局(USPTO)購買美國專利書目資料，之後便自行研發專利資料庫搜尋引擎，建置專利資料庫系統，五月，正式推出國內第一個美國專利資料庫檢索引擎 WebPat，提供全民免費檢索美國專利資料。 同時連穎科技也與全球著名專利科技服務公司合作，提供全球的專利全文影像說明書服務，讓國人得以輕易掌握全球專利資訊，並解決長期以來調閱全球專利全文影像受限於國際網路傳輸品質不穩定之困擾。 以上成就不僅在國內獲得熱情的肯定，更引起國際大廠的注意，連穎科技也首次在國際舞臺上嶄露頭角。

2002年，連穎科技成功研發出「PatentTech技術領航員」，是為一新的里程碑，同年並榮獲經濟部中小企業處遴選為「活化創業成功經驗」示範廠商之一。

2003年是連穎科技結實磊磊的一年，其一是由連穎科技獨家建置且營運的「TWPAT 中華民國專利資訊網」正式上線，是台灣第一個免費專利資料庫，使國人在專利資料檢索上不再需要依靠傳統的方式，其方便性和良好的服務機制，使其營運至今倍受讚譽。 其二，以TextMining技術研發的「PatentExplorer 專利探勘系統」及解決企業內部智財管理不便的「E.P.S. 企業專利管理系統」也在此時正式上市，另外PantentGuider之網路版「M-Trends」亦正式上線。 之前的辛勤耕耘都在此時紛紛開花結果。2003年，對連穎科技來說，是豐收的一年。

	2004年仍持續投入在新技術領域的研發（如：「合約管理系統」、「商標管理系統」），並且仍在舊有的產品和系統上不斷精進，例如連穎科技的代表之作PatentGuider在2005年時推出了2.0版，增加了更多突破性的功能，也正顯示連穎科技豐沛的企業能量，就如源頭活水般的源源不絕。